En algunos casos el paquete que viene por defecto de PHPUnit en los últimos sistemas operativos no funciona de manera correcta, como por ejemplo, a mi me sucedio con Ubuntu 11.04.
Para solucionarlo simplemente hay que eliminar la versión de PHPUnit previamente instalada, si es que existiera alguna, y instalamos el paquete desde PEAR ( Distribución de componentes de PHP).
Luego descubrimos el canal en el que se comparte el componente, y lo instalamos junto a PEAR.
sudo pear channel-discover pear.phpunit.de
sudo pear channel-discover components.ez.no
sudo pear channel-discover pear.symfony-project.com
sudo pear install -f phpunit/PHPUnit
Luego de esto deberíamos tener PEAR funcionando de manera adecuada en nuestro sistema. Espero que les sirva !!!.
PS: Si no tienes PEAR instalado en tu equipo, en general este se encuentra en repositorios como «php-pear».
sudo apt-get install php-pear